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Offre de thèse à Chimie/Biochimie, dérivés de GAG à l’Ifremer de Nantes

par Emmanuel Maes - publié le

Titre du sujet de thèse proposé : Dérivés glycosaminoglycane mimétiques
d’exopolysaccharides de bactéries marines et développement d’une stratégie pour leur
analyse structurale

Voici un résumé du sujet proposé et financé :

- Directrice de thèse : Sylvia Colliec-Jouault
- Co-directrices de thèse et co-encadrante : Muriel Pipelier et Agata Zykwinska

Les polysaccharides sulfatés tels que les glycosaminoglycanes (GAG) jouent des fonctions
essentielles dans la physiologie des tissus animaux. Ces molécules bioactives sont
recherchées en tant que constituants de biomatériaux pour l’ingénierie tissulaire ou comme
principes actifs pour le traitement et la prévention de pathologies majeures. Dans la recherche
de nouvelles molécules bioactives produites selon des procédés biotechnologiques, les
bactéries marines constituent un réservoir considérable de molécules. Ainsi, les
exopolysaccharides (EPS) produits par ces bactéries sont une source renouvelable de
molécules biocompatibles et biodégradables. Afin d’augmenter leurs propriétés GAGmimétiques,
les EPS natifs sont modifiés pour obtenir des dérivés de plus faible masse molaire
et plus sulfatés. Ainsi, le but de la thèse est de répondre à deux questions principales : (1)
quelle est la structure fine des dérives produits ? et (2) comment les modifications apportées à
la molécules modulent sa bioactivité ? Pour répondre à ces questions, les motifs élémentaires
(oligosaccharides) représentatifs de la molécule complexe seront produits via trois approches :
(1) synthèse chimique de l’unité répétitive de l’EPS et de ses analogues, (2) dépolymérisation
par voie chimique ou enzymatique de l’EPS natif et de ses dérivés et (3) modification
(sulfatation) sélective par hémisynthèse. La caractérisation fine de motifs structuraux obtenus
devrait aboutir à l’élucidation de la relation entre la structure du dérivé produit et sa bioactivité
et ainsi, à l’obtention de fractions bioactives valorisables en santé humaine.

- Profil de candidature souhaitée
Chimiste/Biochimiste, profil chimie des polymères et polysaccharides. Bonnes connaissances
en chimie analytique. Compétences en biochimie, glycobiologie et sur les glycosaminoglycanes
appréciées.